研讨提醒莲雾果实老练发育最重要的调控基因

时间:2024-10-29   来源:柚子系列
 

  莲雾,又叫水蓊果,属桃金娘科蒲桃属热带常绿乔木果树。广泛培养在我国广西、海南、广东、云南、台湾等地。莲雾果实口感脆嫩、滋味清甜,水分足够热量低,富含膳食纤维,具有较高的营养价值。莲雾作为新式的热带生果,因其培养前史较短,散布较限制,致使相关的根底研讨较落后。因为缺少培养莲雾基因组序列和相关遗传研讨,严峻阻止了莲雾的育种进程。

  近来,海南大学莲雾研讨团队在《园艺研讨》上宣布论文,研讨人员选用黑糖芭比莲雾作为研讨种类,运用长读长测序技能对二倍体莲雾基因组拼装,拼装得出676.1 兆碱基的莲雾基因组,共11条染色体。对基因组注释得到45914个编码基因。GC占比基因组40.87%,重复序列占比51.27%。

  系统发育剖析标明,莲雾与近缘物种丁香别离大约在15百万年前。经过核型剖析发现,莲雾祖先在6500万年前阅历了桃金娘科共有的全基因组多倍化事情。

  研讨团队还采纳不同发育阶段的莲雾果实以及在各种器官中的转录组资料,包含20地利的小果、40地利的小果、60地利的中果、75地利的中果、95地利的大果、110地利的大果、120地利的老练果、功能性叶片、花朵和茎。对上述资料来转录组测序,经过时刻趋势改变剖析发现与莲雾果实发育老练趋势共同的要害基因模块,得到权重占比最重的三个NAC转录因子;结合共表达网络、热图制作、进化剖析进一步确证三个NAC转录因子Ssam8.1288 (SsNAC106)、Ssam8.1083 (SsNAC105)和Ssam7.3635 (SsNAC94)是莲雾果实老练发育最重要的调控基因。

  综上,该研讨使用新式长读长测序技能获得了莲雾高水平参阅基因组序列,为莲雾的遗传研讨和基因发掘奠定了根底,也敞开了莲雾分子育种的新征途。

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